RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TET1	Q8NFU7	2136 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TXK	P42681	527 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TTC38	Q5R3I4	469 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ZNF365	Q70YC5	407 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RDM1	Q8NG50	284 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		19.98	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	FGB	P02675	491 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	CTSH	P09668	335 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ATP4A	P20648	1035 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RFC2	P35250	354 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ADAM17	P78536	824 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R5C	Q13362	524 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	UGCG	Q16739	394 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TMEM240	Q5SV17	173 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902		Q7L0L9	218 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RSPH3	Q86UC2	560 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	SNX21	Q969T3	373 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	VAV3	Q9UKW4	847 aa		19.97	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	EML1	O00423	815 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RSPH10B	P0C881	870 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	KLRC1	P26715	233 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	PRKCE	Q02156	737 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RBL2	Q08999	1139 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	BANK1	Q8NDB2	785 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	FAM167A	Q96KS9	214 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		19.96	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	OAT	P04181	439 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	PFKM	P08237	780 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	PDC	P20941	246 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC10	P48553	1259 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	NBR1	Q14596	966 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	COL1A2	P08123	1366 aa		19.95	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	ZBBX	A8MT70	800 aa		19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	ZNF862	O60290	1169 aa		19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	ACTN1	P12814	892 aa		19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		19.94	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	COL6A3	P12111	3177 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	CAND2	O75155	1236 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	OR52Z1	P0C646	297 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	PSMC5	P62195	406 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	EPHA7	Q15375	998 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	METTL13	Q8N6R0	699 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MTMR9	Q96QG7	549 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		19.93	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	NBN	O60934	754 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TEC	P42680	631 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	CYP4A11	Q02928	519 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	MTERF2	Q49AM1	385 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	XKR3	Q5GH77	459 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	DYDC2	Q96IM9	177 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	RGL1	Q9NZL6	768 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		19.92	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902		M0QZ92	97 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	IER5	Q5VY09	327 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	FERMT3	Q86UX7	667 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	TPH2	Q8IWU9	490 aa		19.91	■□□□□ 0.78
USP19-210	ENST00000465902	HERVK_113	Q902F9	699 aa		19.91	■□□□□ 0.78

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