RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465393.1

TNIK-208, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-208ENST00000465393 COL6A3P12111 3177 aa22.7■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 JAK3P52333 1124 aa22.7■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 TRIM29Q14134 588 aa22.7■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 RABEP1Q15276 862 aa22.7■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 TCTN1Q2MV58 587 aa22.7■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 LETM2Q2VYF4 491 aa22.7■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.7■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.7■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.7■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.69■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.69■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.69■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.69■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.69■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 SEPT8Q92599 483 aa22.69■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 CHMP2AO43633 222 aa22.68■■□□□ 1.22
TNIK-208ENST00000465393 CHRNA1P02708 482 aa22.68■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 NR5A1Q13285 461 aa22.68■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.67■■□□□ 1.22
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TNIK-208ENST00000465393 GJB5O95377 273 aa22.63■■□□□ 1.21
TNIK-208ENST00000465393 OATP04181 439 aa22.63■■□□□ 1.21
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TNIK-208ENST00000465393 PRKCEQ02156 737 aa22.63■■□□□ 1.21
TNIK-208ENST00000465393 LPIN1Q14693 890 aa22.63■■□□□ 1.21
TNIK-208ENST00000465393 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
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