RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 STAT5AP42229 794 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MTMR1Q13613 665 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CALML6Q8TD86 181 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 COG1Q8WTW3 980 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MTMR8Q96EF0 704 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 WRNIP1Q96S55 665 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 BTBD7Q9P203 1132 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 RASSF10A6NK89 507 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF839A8K0R7 811 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 N4BP3O15049 544 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CDR1P51861 262 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC38Q5R3I4 469 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 C7orf31Q8N865 590 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ACAP3Q96P50 834 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXB1Q99853 325 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 DLL4Q9NR61 685 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MAFGO15525 162 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 C8BP07358 591 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ROM1Q03395 351 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 INCENPQ9NQS7 918 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 GALNT8Q9NY28 637 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MSRAQ9UJ68 235 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM1AO60341 852 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP7B1O75881 506 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO21O94952 628 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ERVK-21P61565 698 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PFKPQ01813 784 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ODR4Q5SWX8 454 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PROSER1Q86XN7 944 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 DTX3Q8N9I9 347 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR48Q8TAF3 677 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNN1Q92952 543 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MAML3Q96JK9 1138 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ALDH1L1O75891 902 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CFBP00751 764 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ATF2P15336 505 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHB1P54762 984 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 DLG4P78352 724 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TTLL6Q8N841 843 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CLIC6Q96NY7 704 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SHTN1A0MZ66 631 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PRLP01236 227 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NCKAP1LP55160 1127 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXO4P98177 505 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MCTP1Q6DN14 999 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KYQ8NBH2 561 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM84AQ96KN4 292 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 BTBD2Q9BX70 525 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 VTA1Q9NP79 307 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 GABRDO14764 452 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MPIG6BO95866 241 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CHGBP05060 677 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 GLDCP23378 1020 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MC3RP41968 323 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ECE1P42892 770 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NEK2P51955 445 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 BCAR1P56945 870 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT85P78386 507 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 INAVAQ3KP66 663 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 LIPIQ6XZB0 460 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms