RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 LXNQ9BS40 222 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG12-201ENST00000461448 MED24O75448 989 aa21.89■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 RPA1P27694 616 aa21.89■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 SLC26A2P50443 739 aa21.89■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.89■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.89■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF862O60290 1169 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ATP4AP20648 1035 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PLCB4Q15147 1175 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 EPSTI1Q96J88 318 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 TRPC6Q9Y210 931 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 POTEB3A0JP26 581 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 HAS3O00219 553 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PRKCEQ02156 737 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 POTEBQ6S5H4 581 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 USP49Q70CQ1 688 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 OATP04181 439 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ITGA7Q13683 1181 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 C7orf31Q8N865 590 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 FSIP1Q8NA03 581 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 COL6A1P12109 1028 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 XKR3Q5GH77 459 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 HYIQ5T013 277 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 POTEGQ6S5H5 508 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 C4orf19Q8IY42 314 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 FAM167AQ96KS9 214 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PLIN2Q99541 437 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 A0A087WWV3 80 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ECM1Q16610 540 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 GRIN2DO15399 1336 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 A0A1B0GVL5 298 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 HBP1O60381 514 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PFKFB1P16118 471 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 IQUBQ8NA54 791 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 USP25Q9UHP3 1055 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 HPSEQ9Y251 543 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM150BA6NC51 233 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB39O15060 712 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 STBD1O95210 358 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 LYPLA2O95372 231 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 MBD3O95983 291 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 INSRRP14616 1297 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 SYKP43405 635 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 IGBP1P78318 339 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PPFIA1Q13136 1202 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 GRB10Q13322 594 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PNMA5Q96PV4 448 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 NACC1Q96RE7 527 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 PANK2Q9BZ23 570 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 CUEDC2Q9H467 287 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 DNM3Q9UQ16 869 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG12-201ENST00000461448 ARVCFO00192 962 aa21.83■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.83■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.83■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 ANO5Q75V66 913 aa21.83■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 SETD4Q9NVD3 440 aa21.83■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 STAT6P42226 847 aa21.82■■□□□ 1.08
SNHG12-201ENST00000461448 NDUFA8P51970 172 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms