RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 TNS4Q8IZW8 715 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ERMNQ8TAM6 284 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 LXNQ9BS40 222 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 AZI2Q9H6S1 392 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PQY0 241 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 POTEB3A0JP26 581 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 H3BRB1 525 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CABYRO75952 493 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 PSEN2P49810 448 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 SLC26A2P50443 739 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 PSMC6P62333 389 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 PRKCEQ02156 737 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 MFSD10Q14728 455 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ECM1Q16610 540 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 HYIQ5T013 277 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 RESP18Q5W5W9 173 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KRT79Q5XKE5 535 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 POTEBQ6S5H4 581 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CABP7Q86V35 215 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 GLG1Q92896 1179 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 EPSTI1Q96J88 318 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 PNMA5Q96PV4 448 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 GRIN2DO15399 1336 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 BRCA2P51587 3418 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ALPK3Q96L96 1907 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 SLC26A4O43511 780 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 LYPLA2O95372 231 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 OATP04181 439 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 MARK3P27448 753 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 UBA7P41226 1012 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 GRB10Q13322 594 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 PLCB4Q15147 1175 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ADALQ6DHV7 355 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 POTEGQ6S5H5 508 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 TPH2Q8IWU9 490 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 C4orf19Q8IY42 314 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KIF12Q96FN5 646 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087WWV3 80 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PQ27 194 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PQ64 194 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PQD8 194 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM150BA6NC51 233 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB39O15060 712 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 MAP3K13O43283 966 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 MUTP22033 750 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CMA1P23946 247 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 XKR3Q5GH77 459 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 ANO5Q75V66 913 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KCNK18Q7Z418 384 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 LRRC15Q8TF66 581 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 FAM167AQ96KS9 214 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 GBP4Q96PP9 640 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.46□□□□□ -0.57
GARNL3-211ENST00000460176 KAT6AQ92794 2004 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 COL1A2P08123 1366 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087X0B3 334 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 HBP1O60381 514 aa11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms