RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447609.5

LMO3-209, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,365 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-209ENST00000447609 VPS16Q9H269 839 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CACNA1SQ13698 1873 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 TTC36A6NLP5 189 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 LGALS16A8MUM7 142 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 C19orf81C9J6K1 198 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 RTN2O75298 545 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CDC27P30260 824 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 C1QTNF8P60827 252 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CUL1Q13616 776 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CUL4BQ13620 913 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 VGLL4Q14135 290 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 SBK1Q52WX2 424 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 TTMPQ5BVD1 217 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 TCP11X2Q5H9J9 407 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 KCTD1Q719H9 257 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 MFN1Q8IWA4 741 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 TAF4BQ92750 862 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CEP95Q96GE4 821 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 NOD2Q9HC29 1040 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 HAUS2Q9NVX0 235 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 TAB2Q9NYJ8 693 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-209ENST00000447609 BICDL2A1A5D9 508 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L15C9J2P7 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L11C9JVI0 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L18D6R9N7 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L22D6RA61 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L19D6RCP7 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L20D6RJB6 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 F5H6K3 240 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ABLIM1O14639 778 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PSMA7O14818 248 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MGRN1O60291 552 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ATP6V1G2O95670 118 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 SLURP2P0DP57 97 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FERP16591 822 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 BMP6P22004 513 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CNGA1P29973 690 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 SCTRP47872 440 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 NAPAP54920 295 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ATP11AP98196 1134 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 KLRC3Q07444 240 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 USP17L24Q0WX57 530 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 KCTD2Q14681 263 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PPP2R5BQ15173 497 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ALX1Q15699 326 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HOOK3Q86VS8 718 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ARL8AQ96BM9 186 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 NOX5Q96PH1 765 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 THAP9Q9H5L6 903 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TRPC6Q9Y210 931 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MYH3P11055 1940 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ALDH1A1P00352 501 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 CCND1P24385 295 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HOXD10P28358 340 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 GUCY1A3Q02108 690 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 KCTD16Q68DU8 428 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 MB21D1Q8N884 522 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 NEDD1Q8NHV4 660 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-209ENST00000447609 COA7Q96BR5 231 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms