RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 MED24O75448 989 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-202ENST00000445482 NR1D1P20393 614 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-202ENST00000445482 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-202ENST00000445482 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SIPA1L1O43166 1804 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 F5H6K3 240 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 MEIS1O00470 390 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 GUCY1A3Q02108 690 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 KLRC3Q07444 240 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 MREGQ8N565 214 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 GUCY2FP51841 1108 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 NAA35Q5VZE5 725 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CD302Q8IX05 232 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.51■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 FSBPO95073 299 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 DNA2P51530 1060 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 DACT2Q5SW24 774 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 POLD4Q9HCU8 107 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 NYAP2Q9P242 653 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PPP1R37O75864 691 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ARHGAP4P98171 946 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 DCAF4Q8WV16 495 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CABS1Q96KC9 395 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.5■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PALMO75781 387 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 APBA3O96018 575 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PSMC6P62333 389 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 JAG1P78504 1218 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 KCNMA1Q12791 1236 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 EMC10Q5UCC4 262 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 HGSNATQ68CP4 663 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 WHAMMQ8TF30 809 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 MKL1Q969V6 931 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 KRT12Q99456 494 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CYP11B2P19099 503 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 FNTAP49354 379 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 AOC3Q16853 763 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 AKT1S1Q96B36 256 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa23.49■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 MYO1FO00160 1098 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 NDUFB10O96000 172 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CHRNA5P30532 468 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 USP11P51784 963 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PTGISQ16647 500 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 FTCDO95954 541 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 GH2P01242 217 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.355e-6■■■■□ 24.2
VGF-202ENST00000445482 HYIQ5T013 277 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 AMNQ9BXJ7 453 aa23.48■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ARSHQ5FYA8 562 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 RPAINQ86UA6 219 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 IDI2Q9BXS1 227 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 MDH1P40925 334 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 FBXO11Q86XK2 927 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.47■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 FAM86B1E9PN63 330 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 SERPING1P05155 500 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CASP5P51878 434 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 CYP4A11Q02928 519 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 NLRP14Q86W24 1093 aa23.46■■□□□ 1.35
VGF-202ENST00000445482 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms