RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDK7P50613 346 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAM17P78536 824 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRKCEQ02156 737 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP4A11Q02928 519 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 XKR3Q5GH77 459 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HYIQ5T013 277 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRT79Q5XKE5 535 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POTEBQ6S5H4 581 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C7orf31Q8N865 590 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BANK1Q8NDB2 785 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DYDC2Q96IM9 177 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA32Q96LK8 384 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TOX2Q96NM4 488 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSRNP2Q9H175 543 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGL1Q9NZL6 768 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPME1Q9Y570 386 aa9.15□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CENPFP49454 3210 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL1A2P08123 1366 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PP2D1A8MPX8 630 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HBP1O60381 514 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCB7O75027 752 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MARK3P27448 753 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ME1P48163 572 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGS19P49795 217 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANO5Q75V66 913 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPH2Q8IWU9 490 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLIC6Q96NY7 704 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.14□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PQ27 194 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PQ64 194 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PQD8 194 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD4P01730 458 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNAT1P11488 350 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 INSRRP14616 1297 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDC25AP30304 524 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TXLNAP40222 546 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBA7P41226 1012 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPFIA1Q13136 1202 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIC1Q14526 733 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRIK4Q16099 956 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ECM1Q16610 540 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM60Q495X7 471 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADALQ6DHV7 355 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POTEGQ6S5H5 508 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHC4Q6S5L8 630 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP49Q70CQ1 688 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CABP7Q86V35 215 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNMA5Q96PV4 448 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NACC1Q96RE7 527 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEP89Q96ST8 783 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SETD4Q9NVD3 440 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRPC6Q9Y210 931 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCM3APO60318 1980 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.13□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B4GALT4O60513 344 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C22orf31O95567 290 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CMA1P23946 247 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RFC5P40937 340 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RARRES1P49788 294 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms