RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-204	ENST00000427778	PPFIA3	O75145	1194 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	ATG7	O95352	703 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	LARGE1	O95461	756 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	AR	P10275	920 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	GNAT1	P11488	350 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	SELP	P16109	830 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	IGFBP4	P22692	258 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	SLC26A2	P50443	739 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	CCL23	P55773	120 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	NLRP5	P59047	1200 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	HIC1	Q14526	733 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF365	Q70YC5	407 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	WASF1	Q92558	559 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	EVPL	Q92817	2033 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	AIFM3	Q96NN9	605 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	PBX4	Q9BYU1	374 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.03	□□□□□ -0.8
LINC00963-204	ENST00000427778	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	CCNE2	O96020	404 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	CXCL10	P02778	98 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	CKB	P12277	381 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	XBP1	P17861	261 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	CYP3A7	P24462	503 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF76	P36508	570 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ACTR2	P61160	394 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ADGRE1	Q14246	886 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	SCLY	Q96I15	445 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	PCYT2	Q99447	389 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		10.02	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	FGB	P02675	491 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
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LINC00963-204	ENST00000427778	BMP1	P13497	986 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	KRT76	Q01546	638 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	SP4	Q02446	784 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	GPNMB	Q14956	572 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778		Q4G0T1	1027 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	PRR16	Q569H4	304 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	NECAB1	Q8N987	351 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	WNT8B	Q93098	351 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	RIT2	Q99578	217 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	TREH	O43280	583 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ACTN1	P12814	892 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	KCNQ1	P51787	676 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	TFF2	Q03403	129 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	RABEP1	Q15276	862 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10	□□□□□ -0.81
LINC00963-204	ENST00000427778	GLG1	Q92896	1179 aa		10	□□□□□ -0.81

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