RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.28■□□□□ 0.84
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SEMA3B-201ENST00000416295 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.28■□□□□ 0.84
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SEMA3B-201ENST00000416295 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.25■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 EML1O00423 815 aa20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3B-201ENST00000416295 PSMC5P62195 406 aa20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3B-201ENST00000416295 UGCGQ16739 394 aa20.24■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3B-201ENST00000416295 EPHA7Q15375 998 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF174Q15697 407 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 XKR3Q5GH77 459 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM26DQ5JW98 314 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 RASIP1Q5U651 963 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.23■□□□□ 0.83
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SEMA3B-201ENST00000416295 BANK1Q8NDB2 785 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 NBNO60934 754 aa20.22■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 OR52Z1P0C646 297 aa20.22■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.22■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.22■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 KAT6AQ92794 2004 aa20.22■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 M0QZ92 97 aa20.21■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 MAGEB2O15479 319 aa20.21■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 BAIAP3O94812 1187 aa20.21■□□□□ 0.83
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SEMA3B-201ENST00000416295 GPNMBQ14956 572 aa20.21■□□□□ 0.83
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SEMA3B-201ENST00000416295 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.21■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SEMA3B-201ENST00000416295 COL6A3P12111 3177 aa20.2■□□□□ 0.82
SEMA3B-201ENST00000416295 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SEMA3B-201ENST00000416295 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.2■□□□□ 0.82
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SEMA3B-201ENST00000416295 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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