RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 SFMBT2Q5VUG0 894 aa26.9■■□□□ 1.9
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FAAP20-206ENST00000414253 UTRNP46939 3433 aa26.9■■□□□ 1.9
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FAAP20-206ENST00000414253 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.9■■□□□ 1.9
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FAAP20-206ENST00000414253 FAM153CQ494X1 144 aa26.89■■□□□ 1.9
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FAAP20-206ENST00000414253 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-206ENST00000414253 FAM153AQ9UHL3 310 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-206ENST00000414253 SAMM50Q9Y512 469 aa26.89■■□□□ 1.9
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FAAP20-206ENST00000414253 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
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FAAP20-206ENST00000414253 POTEB3A0JP26 581 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 POTECB2RU33 542 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 ZEB2O60315 1214 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 GUCY2CP25092 1073 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 INPP5BP32019 993 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 STAT3P40763 770 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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FAAP20-206ENST00000414253 POTEBQ6S5H4 581 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.896e-7■■■■■ 35.3
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FAAP20-206ENST00000414253 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 SLC26A4O43511 780 aa26.88■■□□□ 1.89
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FAAP20-206ENST00000414253 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.87■■□□□ 1.89
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FAAP20-206ENST00000414253 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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FAAP20-206ENST00000414253 KLRC1P26715 233 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.86■■□□□ 1.89
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FAAP20-206ENST00000414253 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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FAAP20-206ENST00000414253 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 MED24O75448 989 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 SLC18A3Q16572 532 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 Q4G0T1 1027 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 CLRN2A0PK11 232 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 TRAF5O00463 557 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 OPLAHO14841 1288 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 SREBF1P36956 1147 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 TTLL6Q8N841 843 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 LENG9Q96B70 501 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 TBX3O15119 743 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 LSP1P33241 339 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 DNA2P51530 1060 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 TBC1D5Q92609 795 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-206ENST00000414253 DPEP1P16444 411 aa26.84■■□□□ 1.89
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