RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 IGBP1P78318 339 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 TET1Q8NFU7 2136 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 PITPNM1O00562 1244 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 PRPHP41219 470 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 TECP42680 631 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 PSMC5P62195 406 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 RBL2Q08999 1139 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 PKP1Q13835 747 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 CAGE1Q8TC20 777 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 BADQ92934 168 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 LXNQ9BS40 222 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD12-202ENST00000406506 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CYP4A11Q02928 519 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 BFSP2Q13515 415 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 NEK9Q8TD19 979 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 DYDC2Q96IM9 177 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 RGL1Q9NZL6 768 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 STBD1O95210 358 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 XKR3Q5GH77 459 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 MFSD5Q6N075 450 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 GDF15Q99988 308 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 BMP15O95972 392 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 F13A1P00488 732 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CCL23P55773 120 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TCHHQ07283 1943 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM150BA6NC51 233 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 C22orf31O95567 290 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CKBP12277 381 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 FPGSQ05932 587 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 IL17AQ16552 155 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 C4orf19Q8IY42 314 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 SCLYQ96I15 445 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 SLITRK3O94933 977 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 SELPP16109 830 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ANO5Q75V66 913 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM199Q8N511 208 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 RETREG2Q8NC44 543 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ERMNQ8TAM6 284 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 RAB34Q9BZG1 259 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CLIC4Q9Y696 253 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CAND2O75155 1236 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 CSF2RAP15509 400 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 KLRC1P26715 233 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 THPOP40225 353 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 PDIA5Q14554 519 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 PTPAQ15257 358 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 MTERF2Q49AM1 385 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXD12-202ENST00000406506 TPH2Q8IWU9 490 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms