RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.96■■□□□ 1.75
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CNN3-202ENST00000394202 TRIM50Q86XT4 487 aa25.94■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 AFG1LQ8WV93 481 aa25.93■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 RNF214Q8ND24 703 aa25.93■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.92■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 ERO1AQ96HE7 468 aa25.91■■□□□ 1.74
CNN3-202ENST00000394202 REEP2Q9BRK0 252 aa25.91■■□□□ 1.74
CNN3-202ENST00000394202 FSD2A1L4K1 749 aa25.9■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.9■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 UNC13DQ70J99 1090 aa25.89■■□□□ 1.74
CNN3-202ENST00000394202 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.89■■□□□ 1.74
CNN3-202ENST00000394202 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.89■■□□□ 1.74
CNN3-202ENST00000394202 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.89■■□□□ 1.74
CNN3-202ENST00000394202 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.89■■□□□ 1.74
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CNN3-202ENST00000394202 XKR9Q5GH70 373 aa25.89■■□□□ 1.73
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CNN3-202ENST00000394202 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.88■■□□□ 1.73
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CNN3-202ENST00000394202 XKR3Q5GH77 459 aa25.87■■□□□ 1.73
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CNN3-202ENST00000394202 SFI1A8K8P3 1242 aa25.87■■□□□ 1.73
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CNN3-202ENST00000394202 OATP04181 439 aa25.87■■□□□ 1.73
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