RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 PNMA3Q9UL41 463 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 TLDC2A0PJX2 215 aa23.65■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 LRRD1A4D1F6 860 aa23.65■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 MAP3K13O43283 966 aa23.65■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.64■■□□□ 1.37
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OPN3-201ENST00000366554 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.63■■□□□ 1.37
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OPN3-201ENST00000366554 FGRP09769 529 aa23.62■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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OPN3-201ENST00000366554 UNC13DQ70J99 1090 aa23.62■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 NLRP3Q96P20 1036 aa23.62■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 RGL1Q9NZL6 768 aa23.62■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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OPN3-201ENST00000366554 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.62■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.62■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V1C1P21283 382 aa23.62■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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OPN3-201ENST00000366554 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.61■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.61■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 C2CD2Q9Y426 696 aa23.61■■□□□ 1.37
OPN3-201ENST00000366554 MYBL1P10243 752 aa23.61■■□□□ 1.37
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