RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 JAK3P52333 1124 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 RAPH1Q70E73 1250 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 IFNAR2P48551 515 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PODNQ7Z5L7 613 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 MCF2LO15068 1137 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 STAT3P40763 770 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 NUF2Q9BZD4 464 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SLC4A1P02730 911 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 MAP2K2P36507 400 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SLC7A5Q01650 507 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PLCB4Q15147 1175 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.75■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.75■■□□□ 1.23
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SMURF1-201ENST00000361125 DCLK2Q8N568 766 aa22.75■■□□□ 1.23
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF233A6NK53 670 aa22.74■■□□□ 1.23
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SMURF1-201ENST00000361125 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 POTEB3A0JP26 581 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 POTECB2RU33 542 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 NFIXQ14938 502 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 TMED2Q15363 201 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 STXBP2Q15833 593 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 POTEBQ6S5H4 581 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.74■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PBKQ96KB5 322 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ZWILCHQ9H900 591 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CPP00450 1065 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PRCPP42785 496 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 LRRD1A4D1F6 860 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PP2D1A8MPX8 630 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ADRA2BP18089 450 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ARL4AP40617 200 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CDO1Q16878 200 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 HSPH1Q92598 858 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 VCXQ9H320 206 aa22.73■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 KIF28PB7ZC32 967 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PADI6Q6TGC4 694 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PRPSAP2O60256 369 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 GYS2P54840 703 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 COASYQ13057 564 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF394Q53GI3 561 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 TXNRD1Q16881 649 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PNMA3Q9UL41 463 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 PFDN6O15212 129 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SLC16A4O15374 487 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 BARHL2Q9NY43 387 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.72■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SLCO1A2P46721 670 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP4P98171 946 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP36Q96G28 342 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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