RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 PNMA1Q8ND90 353 aa15.97■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-201ENST00000300213 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 H0YGN5 161 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CREB1P16220 341 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSPA2P54652 639 aa15.96■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.96■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SMCO2A6NFE2 343 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.96■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-201ENST00000300213 EBF2Q9HAK2 575 aa15.96■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.96■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNJ1P48048 391 aa15.96■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 NWD1Q149M9 1564 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM260Q9NX78 707 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 PJA2O43164 708 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 FUT2Q10981 343 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 CALCRLQ16602 461 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 C2CD2Q9Y426 696 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEO1Q92859 1461 aa15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SPATA21Q7Z572 469 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNFRSF25Q93038 417 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 RARAP10276 462 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNH2Q12809 1159 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 BARGINQ6ZT62 677 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 AKAP12Q02952 1782 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINGO3P0C6S8 592 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ECHS1P30084 290 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 CALCOCO2Q13137 446 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 C18orf8Q96DM3 657 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERP27Q96DN0 273 aa15.93■□□□□ 0.14
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