RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 KCND2Q9NZV8 630 aa25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM9Q13443 819 aa25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CHST13Q8NET6 341 aa25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.13■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CXCL11O14625 94 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 NR2F2P24468 414 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 GUCY2CP25092 1073 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF131P52739 623 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 KRT76Q01546 638 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 PADI6Q6TGC4 694 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 FIZ1Q96SL8 496 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 WDR64B1ANS9 1081 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 JAK3P52333 1124 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 NUP58Q9BVL2 599 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.12■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM150BA6NC51 233 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MAFGO15525 162 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 KCNA2P16389 499 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 RARRES1P49788 294 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CNTN2Q02246 1040 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 DAW1Q8N136 415 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 OPTNQ96CV9 577 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ASTN1O14525 1302 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 PDXKO00764 312 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CETN3O15182 167 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 HIP1RO75146 1068 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 LYPLA2O95372 231 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 GNA14O95837 355 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SFNP31947 248 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK7Q13164 816 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 RETREG2Q8NC44 543 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC7Q99615 494 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.11■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 FSTL1Q12841 308 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ODR4Q5SWX8 454 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 KSR1Q8IVT5 923 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CHP1Q99653 195 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 PSMC5P62195 406 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 PPIL2Q13356 520 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 C4orf19Q8IY42 314 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MAF1Q9H063 256 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.1■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 HERVK_113P62684 666 aa25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.09■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 EPHB6O15197 1021 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TGFB1I1O43294 461 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC175P0C221 793 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 FIGNQ5HY92 759 aa25.08■■□□□ 1.61
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.08■■□□□ 1.61
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