RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GAKO14976 1311 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 FAM187AA6NFU0 413 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NPEPPSP55786 919 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CYP4A11Q02928 519 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PLS1Q14651 629 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MIIPQ5JXC2 388 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 WDR59Q6PJI9 974 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CABS1Q96KC9 395 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 NUP98P52948 1817 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L15C9J2P7 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L11C9JVI0 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L18D6R9N7 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L22D6RA61 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L19D6RCP7 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L20D6RJB6 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 WNT7AO00755 349 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GGPS1O95749 300 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 RPA1P27694 616 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ATP1A2P50993 1020 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L24Q0WX57 530 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 Q4G0T1 1027 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BBOF1Q8ND07 529 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB9Q96C00 473 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TRIM11Q96F44 468 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MED15Q96RN5 788 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PLAAQ9Y263 795 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PFASO15067 1338 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MEIS1O00470 390 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ATP2A1O14983 1001 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R5AQ15172 486 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PASKQ96RG2 1323 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 IFT74Q96LB3 600 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 POTEFA5A3E0 1075 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 LCA5LO95447 670 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 POTEIP0CG38 1075 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SOX5P35711 763 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SLMAPQ14BN4 828 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 AOC3Q16853 763 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 POTEGQ6S5H5 508 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CERKQ8TCT0 537 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 MTRQ99707 1265 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 AIPL1Q9NZN9 384 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CLIC2O15247 247 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ABCB4P21439 1286 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 DLGAP5Q15398 846 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 RFFLQ8WZ73 363 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 STK33Q9BYT3 514 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ISCUQ9H1K1 167 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TLDC2A0PJX2 215 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PODXLO00592 558 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 ZBED4O75132 1171 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 UCHL3P15374 230 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PDE6CP51160 858 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 USP38Q8NB14 1042 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-201ENST00000264345 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms