RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 NECAB1Q8N987 351 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED1-201ENST00000246139 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 LCHNA4D1U4 455 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 M0R2N6 131 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 EDIL3O43854 480 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 CTDNEP1O95476 244 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 CHRNA1P02708 482 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 BMP1P13497 986 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 NPY5RQ15761 445 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 ME3Q16798 604 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 POTEB3A0JP26 581 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 LARGE1O95461 756 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 XBP1P17861 261 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 SLC26A2P50443 739 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 POTEBQ6S5H4 581 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 RPAINQ86UA6 219 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 LENG9Q96B70 501 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 GHRP10912 638 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 KCNQ1P51787 676 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 C8orf34Q49A92 452 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 APBB2Q92870 758 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 GTF3C6Q969F1 213 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 ZNF302Q9NR11 478 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 MSH4O15457 936 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 UPP2O95045 317 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 COL9A1P20849 921 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 KRT76Q01546 638 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 WASF1Q92558 559 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 INSL6Q9Y581 213 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 LPXNO60711 386 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 IER5Q5VY09 327 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 SAMM50Q9Y512 469 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 M0QZ92 97 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 HBP1O60381 514 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 PSAPP07602 524 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 MGAT3Q09327 533 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 LPIN1Q14693 890 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 Q4G0T1 1027 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-201ENST00000246139 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 TDP2O95551 362 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 CYP3A7P24462 503 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 GRB10Q13322 594 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 INF2Q27J81 1249 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 SLC5A5Q92911 643 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 YME1L1Q96TA2 773 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 RIT2Q99578 217 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 LINC01553A4QN01 128 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 WDR64B1ANS9 1081 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 GAS7O60861 476 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 ATP4AP20648 1035 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 KLRC1P26715 233 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED1-201ENST00000246139 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 173.1 ms