RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 MAGEB2O15479 319 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ARID5AQ03989 594 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ADCY2Q08462 1091 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 LAMB3Q13751 1172 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 RAD54LQ92698 747 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 EXOC4Q96A65 974 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 KRIT1O00522 736 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 GRIN3BO60391 1043 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PRDX5P30044 214 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 MNAT1P51948 309 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CBX1P83916 185 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 COG2Q14746 738 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TXNRD1Q16881 649 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CEP55Q53EZ4 464 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 EFHBQ8N7U6 833 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 MYL10Q9BUA6 226 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 KRT7P08729 469 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CLDN3O15551 220 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ECE2O60344 883 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ALAS1P13196 640 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 MXI1P50539 228 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CHST13Q8NET6 341 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 SKIP12755 728 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 I3L4J1 428 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP4P98171 946 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CD302Q8IX05 232 aa6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L15C9J2P7 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L11C9JVI0 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L18D6R9N7 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L22D6RA61 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L19D6RCP7 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L20D6RJB6 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PIK3CAP42336 1068 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 USP17L24Q0WX57 530 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 GCNT4Q9P109 453 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 NDUFAB1O14561 156 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 GTF2H1P32780 548 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 A6NJR5 290 aa6.84□□□□□ -1.31
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SETX-201ENST00000224140 DNERQ8NFT8 737 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 NNTQ13423 1086 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CASP14P31944 242 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 FMO2Q99518 471 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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