RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173357.7

Nelfe-204, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa27.6■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa27.6■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fmnl1Q9JL26 1094 aa27.6■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Clk2O35491 499 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Axin2O88566 840 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ccr1P51675 355 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Usp49Q6P9L4 685 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Olfr397Q8VEZ6 315 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dusp6Q9DBB1 381 aa27.59■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Syngap1F6SEU4 1340 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pate3B3GLJ3 98 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cd72P21855 354 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 AcrP23578 436 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kmt5aQ2YDW7 349 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Prl2c1Q5SVL9 228 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fermt2Q8CIB5 680 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Krt79Q8VED5 531 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nrbp1Q99J45 535 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Josd2Q9CR30 188 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 TtpalQ9D3D0 343 aa27.58■■■□□ 2.01
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam205aA2APU8 1308 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ankrd16A2AS55 361 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Svs3aF2Z472 265 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cd70O55237 195 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nfe2Q07279 373 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mief2Q5NCS9 454 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 F13a1Q8BH61 732 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 VcpkmtQ8C436 228 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Sppl3Q9CUS9 384 aa27.57■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 DgkkE9Q7N4 1118 aa27.56■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gnrh1P13562 90 aa27.56■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Aldh1a1P24549 501 aa27.56■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cd22P35329 862 aa27.56■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Hoxb13P70321 286 aa27.56■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Spink5Q148R4 1017 aa27.56■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa27.56■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ccl26F8VQM2 93 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ppp1r13bQ62415 1087 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 C6.1alQ7M757 291 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam109aQ8BH49 266 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Stoml1Q8CI66 399 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam20aQ8CID3 541 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Krtap5-3Q9D226 196 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Eya4Q9Z191 616 aa27.55■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa27.54■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Casp7P97864 303 aa27.54■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Syce2Q505B8 171 aa27.54■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 RragbQ6NTA4 374 aa27.54■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 IqceQ6PCQ0 778 aa27.54■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Supt3B0QZW4 406 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Vmn2r71L7N2D8 855 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Il4rP16382 810 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tmod1P49813 359 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 MafP54843 370 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Olfr119Q7TRJ5 321 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Thap3Q8BJ25 218 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Hps3Q91VB4 1002 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dqx1Q924H9 718 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Trpm5Q9JJH7 1158 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tle2Q9WVB2 767 aa27.53■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Arhgap6O54834 987 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Scp2P32020 547 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Znf800Q0VEE6 662 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Arhgef16Q3U5C8 713 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ccdc15Q8C9M2 810 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 OtoaQ8K561 1137 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rtfdc1Q99K95 307 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tmem39aQ9CYC3 486 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Atp1a4Q9WV27 1032 aa27.52■■■□□ 2
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Krt36B1AQ75 473 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dapk3O54784 448 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Slc16a2O70324 545 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 P01644 108 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 P01645 108 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 P01646 108 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 P01647 108 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pex1Q5BL07 1284 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Exoc3Q6KAR6 755 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Wbp1lQ8BGW2 348 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cdca8Q8BHX3 289 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Drc3Q9D5E4 523 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Asah2Q9JHE3 756 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Sgpp1Q9JI99 430 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Hs6st3Q9QYK4 470 aa27.51■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Serpina16D3Z660 418 aa27.5■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gm4788E9Q8B5 879 aa27.5■■□□□ 1.99
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cd86P42082 309 aa27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms