RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Drc3Q9D5E4 523 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1700003F12RikA2AKE5 210 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prr7Q3V0I2 269 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Git1Q68FF6 770 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arhgef7Q9ES28 862 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mmrn2A6H6E2 943 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MyocO70624 490 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 IkbkbO88351 757 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mcl1P97287 331 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam89aQ14BJ1 175 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sh3gl1Q62419 368 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tcp10aQ80W76 438 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ecel1Q9JMI0 775 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam183bQ5NC57 135 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sv2cQ69ZS6 727 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm2163Q6PCY5 473 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cct8l1Q80YT3 562 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gtpbp10Q8K013 366 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dppa3Q8QZY3 150 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttc8Q8VD72 515 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Llcfc1Q9D9P8 108 aa18.22■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 D1Pas1P16381 660 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyp11b1Q3TG86 501 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dars2Q8BIP0 653 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 H6pdQ8CFX1 789 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mtmr4Q91XS1 1190 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atp6v1e2Q9D593 226 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpina9Q9D7D2 418 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fthl17aQ9DAX0 182 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fem1bQ9Z2G0 627 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc160Q3UYG1 323 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr832Q7TRG9 312 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rcn2Q8BP92 320 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mis12Q9CY25 206 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CpdO89001 1377 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmod1P49813 359 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr121Q5CZY0 321 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf6Q9DBU5 667 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kif13aQ9EQW7 1749 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serpina16D3Z660 418 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ift81O35594 676 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ZfxP17012 799 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 OatP29758 439 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Frmd8Q3UFK8 466 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sulf1Q8K007 870 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MlklQ9D2Y4 472 aa18.21■□□□□ 0.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stat3P42227 770 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vsnl1P62761 191 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psma8Q9CWH6 250 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Itga2bQ9QUM0 1033 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Diaph3Q9Z207 1171 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr552E9Q545 317 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Grin1P35438 938 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpusd2Q149F1 553 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SrlQ7TQ48 910 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gprasp2Q8BUY8 826 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adgra1Q8C4G9 578 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Snx24Q9CRB0 169 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 InhbaQ04998 424 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tfdp1Q08639 410 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PdhbQ9D051 359 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tcp10bE9PYJ0 438 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hdac10Q6P3E7 666 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Alg3Q8K2A8 438 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Med15Q924H2 789 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ddah1Q9CWS0 285 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem192Q9CXT7 266 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Styxl1Q9DAR2 321 aa18.2■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm3127E9Q9P5 263 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm3453K7N724 263 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ArpinQ9D0A3 226 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 EcsitQ9QZH6 435 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 C3P01027 1663 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hmx1O70218 332 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aco1P28271 889 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CebpaP53566 359 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zmym1Q3TJB1 983 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mad2l2Q9D752 211 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PycardQ9EPB4 193 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Epha2Q03145 977 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nek3Q9R0A5 511 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmed2Q9R0Q3 201 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Man1a2P39098 641 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rtkn2Q14B46 604 aa18.19■□□□□ 0.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem109Q3UBX0 243 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32 ms