RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	HIM1	Q06674	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	THI20	Q08224	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PSY3	Q12318	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RNP1	P32385	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RGT1	P32862	1170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FIG1	P38224	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YBR220C	P38318	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FAA2	P39518	744 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GIP2	P40036	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CHS6	P40955	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BST1	P43571	1029 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	IRC7	P43623	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BIO3	P50277	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	COG7	P53195	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	COQ6	P53318	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YNL181W	P53878	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TRS31	Q03337	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MSC3	Q05812	728 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TMA10	Q06177	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YPS7	Q06325	596 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MDY2	Q12285	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MOD5	P07884	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PUP1	P25043	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	DAL2	P25335	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CDC20	P26309	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GPI10	P30777	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SOL2	P37262	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	HSL7	P38274	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	EXO5	P38289	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RRT2	P38332	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	LAG1	P38703	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YHK8	P38776	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	OSW5	P40219	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	QDR1	P40475	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NAS2	P40555	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FIG4	P42837	879 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	THI12	P42883	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	THI5	P43534	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GUP1	P53154	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TIM13	P53299	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SLM2	P53955	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TIM44	Q01852	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CTF19	Q02732	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	THI13	Q07748	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CDC7	P06243	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	POF1	P25576	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
EXO1	YOR033C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SRB6	P32570	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SUA5	P32579	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
EXO1	YOR033C	AVT5	P38176	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	NSG1	P38837	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CYC2	P38909	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CLA4	P48562	842 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	DSD1	P53095	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PKP2	P53170	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GPI1	P53306	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	VPS9	P54787	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YAP6	Q03935	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YML083C	Q04526	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GAS2	Q06135	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RAD34	Q06665	692 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	HRT3	Q12347	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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