RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	OM45	P16547	393 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NUP2	P32499	720 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	COT1	P32798	439 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MRPL15	P36523	253 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ECM13	P38195	257 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YBR225W	P38321	900 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	AXL2	P38928	823 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TIM17	P39515	158 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SLZ1	P40167	298 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PRM5	P40476	318 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PHB1	P40961	287 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PMT4	P46971	762 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YJR120W	P47157	116 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YJR154W	P47181	346 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MRX6	P48564	524 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	VEL1	P53058	206 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TIM10	P87108	93 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YSA1	Q01976	231 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MUB1	Q03162	620 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MDM30	Q05930	598 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YLR030W	Q07967	263 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	FDH1	Q08911	376 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	DDC1	Q08949	612 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YDL211C	Q12121	372 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SFI1	Q12369	946 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SPO24	Q3E752	67 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	URA4	P20051	364 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	OPI1	P21957	404 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YCL049C	P25577	312 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YKL100C	P34248	587 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MRPL10	P36520	322 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YBR138C	P38277	524 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	VHC1	P38329	1120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MSR1	P38714	643 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	WSC4	P38739	605 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	APE4	P38821	490 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	STN1	P38960	494 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	GAA1	P39012	614 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YAL037W	P39728	267 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	EPL1	P43572	832 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	COG1	P53079	417 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YGL108C	P53139	140 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RTS3	P53289	263 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PGA2	P53903	129 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TGL2	P54857	326 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	INA17	Q02888	182 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YDL144C	Q07589	356 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	AKR2	Q12013	749 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SRO7	Q12038	1033 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RCN2	Q12044	265 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	GEP5	Q12393	293 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SMC6	Q12749	1114 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	LAG2	Q92325	660 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TRA1	P38811	3744 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SAL1	D6W196	494 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CCW14	O13547	238 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MDM35	O60200	86 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SEM1	O94742	89 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TPK1	P06244	397 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	HOM3	P10869	527 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MNE1	P24720	663 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CLB4	P24871	460 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RDS1	P25611	832 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YSC83	P32792	385 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CAB3	P36076	571 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	STB6	P36085	766 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MRPL36	P36531	177 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SIF2	P38262	535 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MSG5	P38590	489 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CCT6	P39079	546 aa		0.96	□□□□□ -2.26

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