RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637050.1

CLN3-254, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,684 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-254ENST00000637050 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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CLN3-254ENST00000637050 ARMCX2Q7L311 632 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 EXOC1Q9NV70 894 aa20.54■□□□□ 0.88
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CLN3-254ENST00000637050 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 CA12O43570 354 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 ACTR2P61160 394 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLN3-254ENST00000637050 NEDD9Q14511 834 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLN3-254ENST00000637050 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLN3-254ENST00000637050 C4orf19Q8IY42 314 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 GDAQ9Y2T3 454 aa20.53■□□□□ 0.88
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CLN3-254ENST00000637050 APLP1P51693 650 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 MYL5Q02045 173 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 MORN1Q5T089 497 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-254ENST00000637050 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.52■□□□□ 0.88
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CLN3-254ENST00000637050 CAPNS2Q96L46 248 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 MED15Q96RN5 788 aa20.51■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.51■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.51■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.5■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 VTA1Q9NP79 307 aa20.5■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 AP5Z1O43299 807 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 SORBS3O60504 671 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 AOC2O75106 756 aa20.49■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.48■□□□□ 0.87
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CLN3-254ENST00000637050 KATNBL1Q9H079 304 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLN3-254ENST00000637050 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.48■□□□□ 0.87
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