RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARMCX2	Q7L311	632 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	IKBKB	O14920	756 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	CA12	O43570	354 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	APLP1	P51693	650 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	DPP9	Q86TI2	863 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	EXOC1	Q9NV70	894 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	MCM3AP	O60318	1980 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZBTB39	O15060	712 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ACTR2	P61160	394 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	NEDD9	Q14511	834 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	MORN1	Q5T089	497 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	PSMC5	P62195	406 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	EHHADH	Q08426	723 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	NCAPH	Q15003	741 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	UGCG	Q16739	394 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	C4orf19	Q8IY42	314 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	GDA	Q9Y2T3	454 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMTNL1	A8MU46	457 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATG7	O95352	703 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARIH2	O95376	493 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	PSAP	P07602	524 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAML3	Q96JK9	1138 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	AOC2	O75106	756 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYL5	Q02045	173 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	WDR81	Q562E7	1941 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	SORBS3	O60504	671 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	IDE	P14735	1019 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	GIT2	Q14161	759 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	LY6K	Q17RY6	165 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	MED15	Q96RN5	788 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	VTA1	Q9NP79	307 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CAPNS1-215	ENST00000628018	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	PRCP	P42785	496 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	SP4	Q02446	784 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	STK4	Q13043	487 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	PSMD2	Q13200	908 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	METTL7B	Q6UX53	244 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	ADSSL1	Q8N142	457 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	PANK4	Q9NVE7	773 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	GGPS1	O95749	300 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	COASY	Q13057	564 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAP2K5	Q13163	448 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	SCFD2	Q8WU76	684 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	KATNBL1	Q9H079	304 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	KCND2	Q9NZV8	630 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	AP5Z1	O43299	807 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	USP6NL	Q92738	828 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	REEP2	Q9BRK0	252 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	TINF2	Q9BSI4	451 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	HOXC6	P09630	235 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CAPNS1-215	ENST00000628018	TTLL4	Q14679	1199 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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