RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 BARHL2Q9NY43 387 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 DACH1Q9UI36 760 aa24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 WNT7AO00755 349 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 ARIH2O95376 493 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 SLFN14P0C7P3 912 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PTGDRQ13258 359 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 MORC3Q14149 939 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF174Q15697 407 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 IL31RAQ8NI17 732 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 SMARCE1Q969G3 411 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 SMCO2A6NFE2 343 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 UBE2SQ16763 222 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 USP49Q70CQ1 688 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 CABYRO75952 493 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 GH1P01241 217 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 BMP6P22004 513 aa24.11■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.11■■□□□ 1.45
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SGMS1-210ENST00000619438 STXBP3O00186 592 aa24.1■■□□□ 1.45
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SGMS1-210ENST00000619438 SMC2O95347 1197 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 MYL3P08590 195 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 ADCY7P51828 1080 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 TLE2Q04725 743 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 LRMPQ12912 555 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 SNX17Q15036 470 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 GNPTABQ3T906 1256 aa24.1■■□□□ 1.45
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SGMS1-210ENST00000619438 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.1■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 STAM2O75886 525 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 ISM2Q6H9L7 571 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 EPSTI1Q96J88 318 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.09■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
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SGMS1-210ENST00000619438 PRR29P0C7W0 189 aa24.08■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 TGFB3P10600 412 aa24.08■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 FANCCQ00597 558 aa24.08■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 IFNKQ9P0W0 207 aa24.08■■□□□ 1.45
SGMS1-210ENST00000619438 A0A087X0B3 334 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CBFA2T2O43439 604 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 RGS20O76081 388 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PDILTQ8N807 584 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.08■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 A6NJR5 290 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ARVCFO00192 962 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ADAMTS3O15072 1205 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 LAMC2Q13753 1193 aa24.07■■□□□ 1.44
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SGMS1-210ENST00000619438 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 AFG1LQ8WV93 481 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 C6orf50Q9HD87 102 aa24.07■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 KPNA6O60684 536 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ITGA7Q13683 1181 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 DHX58Q96C10 678 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 PAGE5Q96GU1 130 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 KCND1Q9NSA2 647 aa24.06■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 LAD1O00515 517 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 SORBS3O60504 671 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP1Q07960 439 aa24.05■■□□□ 1.44
SGMS1-210ENST00000619438 E2F4Q16254 413 aa24.05■■□□□ 1.44
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