RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 NRIP1P48552 1158 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PTPN21Q16825 1174 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 METTL7BQ6UX53 244 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PIGSQ96S52 555 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 GPR20Q99678 358 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 KRT23Q9C075 422 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PRR23AA6NEV1 266 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RUFY4Q6ZNE9 571 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 POF1BQ8WVV4 589 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 NRCAMQ92823 1304 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 CYTH3O43739 400 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 NBL1P41271 181 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP4P98171 946 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 NEDD9Q14511 834 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 GNPTABQ3T906 1256 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 ERMP1Q7Z2K6 904 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RIPOR3Q96MK2 946 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 FIBPO43427 364 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 GRM4Q14833 912 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 VN1R2Q8NFZ6 395 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 IL25Q9H293 177 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-211ENST00000592658 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 ZNF292O60281 2723 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 STAM2O75886 525 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 SP4Q02446 784 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TRAF1Q13077 416 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 SMC5Q8IY18 1101 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 SENP2Q9HC62 589 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TRPC6Q9Y210 931 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 S1PR5Q9H228 398 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TLE6Q9H808 572 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 FAM186AA6NE01 2351 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 HIP1O00291 1037 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 PER2O15055 1255 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 CD52P31358 61 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 KCNC3Q14003 757 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 DUSP6Q16828 381 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 UBE3AQ05086 875 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TROAPQ12815 778 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 PPFIA1Q13136 1202 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 RSPH3Q86UC2 560 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 NEK1Q96PY6 1258 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 SQORQ9Y6N5 450 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.23■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 FSD2A1L4K1 749 aa15.22■□□□□ 0.03
CTIF-211ENST00000592658 ID4P47928 161 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms