RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PI4KBQ9UBF8 816 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ANO9A1A5B4 782 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TBX3O15119 743 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FANCGO15287 622 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC37A4O43826 429 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 USO1O60763 962 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FOSP01100 380 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 BAG6P46379 1132 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SCNN1DP51172 638 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ICA1Q05084 483 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 STK4Q13043 487 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 VWA3BQ502W6 1294 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 HYIQ5T013 277 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SLFN13Q68D06 897 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD40Q6AI12 368 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRN4CLQ8ND94 238 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MKL1Q969V6 931 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 JAKMIP2Q96AA8 810 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 GMCL1Q96IK5 515 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFP42Q96MM3 310 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP63Q96MT8 703 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PNMA5Q96PV4 448 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ANO3Q9BYT9 981 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MYMKA6NI61 221 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 USP17L10C9JJH3 530 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PLSCR1O15162 318 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ENTPD3O75355 529 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MMP10P09238 476 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FCER1AP12319 257 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 IDEP14735 1019 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP3A7P24462 503 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP25P42331 645 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2SQ16763 222 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM26FQ5R3K3 315 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC122Q5T0U0 273 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 C2CD5Q86YS7 1000 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CNKSR1Q969H4 720 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 AMNQ9BXJ7 453 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TTYH3Q9C0H2 523 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EHMT1Q9H9B1 1298 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO6Q9UM54 1294 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MYH4Q9Y623 1939 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SPDYE3A6NKU9 549 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 H0YIN7 160 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ECE2O60344 883 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 APBA3O96018 575 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMP2P16035 220 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 VAV2P52735 878 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF5AQ12840 1032 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 COASYQ13057 564 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP9Q49MG5 647 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC40Q4G0X9 1142 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KCTD1Q719H9 257 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MSANTD4Q8NCY6 345 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 NEK11Q8NG66 645 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC15Q8TF66 581 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.786e-8■□□□□ 9
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC42Q96M95 316 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MBOAT7Q96N66 472 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms