RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589985.5

GPI-212, Transcript of glucose-6-phosphate isomerase, human

TSL 3

Gene GPI, Length 1,516 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPI-212	ENST00000589985	SV2B	Q7L1I2	683 aa		21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	TRPV1	Q8NER1	839 aa		21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	MMP19	Q99542	508 aa		21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	STK24	Q9Y6E0	443 aa		21.5	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	CEP290	O15078	2479 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PARP14	Q460N5	1801 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	MSC	O60682	206 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PLA2G6	O60733	806 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	CYBA	P13498	195 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	CNGA1	P29973	690 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PRCP	P42785	496 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	STX17	P56962	302 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PTPN14	Q15678	1187 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	ANO3	Q9BYT9	981 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	THAP9	Q9H5L6	903 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	EXOC1	Q9NV70	894 aa		21.49	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	BICDL2	A1A5D9	508 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	TBX3	O15119	743 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	ARHGAP6	O43182	974 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PBX1	P40424	430 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	GRB10	Q13322	594 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	HYI	Q5T013	277 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	FEM1B	Q9UK73	627 aa		21.48	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	STX10	O60499	249 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	COL6A1	P12109	1028 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	TRIM14	Q14142	442 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	KCTD2	Q14681	263 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	CCDC51	Q96ER9	411 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	MAML3	Q96JK9	1138 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	GDA	Q9Y2T3	454 aa		21.47	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PFAS	O15067	1338 aa		21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	MARCH6	O60337	910 aa		21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	ZBED4	O75132	1171 aa		21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	CEP135	Q66GS9	1140 aa		21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	KIFC2	Q96AC6	838 aa		21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PNMA5	Q96PV4	448 aa		21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	PANX2	Q96RD6	677 aa		21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	21.46	■■□□□ 1.03
GPI-212	ENST00000589985	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PIK3CD	O00329	1044 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	ATP2A1	O14983	1001 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PGK2	P07205	417 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	TPM1	P09493	284 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	STAT2	P52630	851 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	ASIC1	P78348	528 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	UNC13D	Q70J99	1090 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	RAD54L	Q92698	747 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	KCNJ18	B7U540	433 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	MEIS2	O14770	477 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	ZSCAN12	O43309	604 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	CCNE1	P24864	410 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PDE4D	Q08499	809 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PSMD2	Q13200	908 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	KCNJ12	Q14500	433 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985		Q4G0T1	1027 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	FAM160B2	Q86V87	743 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	TC2N	Q8N9U0	490 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	LRRC15	Q8TF66	581 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	HAS1	Q92839	578 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PLIN2	Q99541	437 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		21.44	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	SREBF1	P36956	1147 aa		21.44	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	KRT31	Q15323	416 aa		21.44	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		21.44	■■□□□ 1.02
GPI-212	ENST00000589985	CPXCR1	Q8N123	301 aa		21.44	■■□□□ 1.02

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