RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	HAS3	O00219	553 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PPP2R5C	Q13362	524 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	B4GALT4	O60513	344 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	CDK7	P50613	346 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PKP1	Q13835	747 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	MTMR9	Q96QG7	549 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	EML1	O00423	815 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	CLTB	P09497	229 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	TEC	P42680	631 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	BANK1	Q8NDB2	785 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	RDM1	Q8NG50	284 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	POTEM	A6NI47	508 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SYN1	P17600	705 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	IGBP1	P78318	339 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PPFIA1	Q13136	1202 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	LAD1	O00515	517 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	F13A1	P00488	732 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SLC26A2	P50443	739 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PLCB4	Q15147	1175 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PTGIS	Q16647	500 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	UGCG	Q16739	394 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	TOX2	Q96NM4	488 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	ARID2	Q68CP9	1835 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	LTBP2	Q14767	1821 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	POTEB3	A0JP26	581 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	FAAP100	Q0VG06	881 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	POTEB	Q6S5H4	581 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SESTD1	Q86VW0	696 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	SETD4	Q9NVD3	440 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	PRKCE	Q02156	737 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	CYP4A11	Q02928	519 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	EPHA7	Q15375	998 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	EVPL	Q92817	2033 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	GNAT1	P11488	350 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2C9	P11712	490 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	GRIK4	Q16099	956 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	DYDC2	Q96IM9	177 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	FAM167A	Q96KS9	214 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	RAB34	Q9BZG1	259 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	CLIC4	Q9Y696	253 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		28	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	BMP15	O95972	392 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	CD4	P01730	458 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	ERMN	Q8TAM6	284 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	LXN	Q9BS40	222 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	NRCAM	Q92823	1304 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	HBP1	O60381	514 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	OAT	P04181	439 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GPS1-223	ENST00000584229	INSRR	P14616	1297 aa		27.98	■■■□□ 2.07

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