RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SCINQ9Y6U3 715 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD9Q5K651 1589 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 WDR91A4D1P6 747 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PTPREP23469 700 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MECOMQ03112 1051 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ESYT2A0FGR8 921 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 LCA5Q86VQ0 697 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 TUBB6Q9BUF5 446 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PTCH1Q13635 1447 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CREB3O43889 395 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD2Q14681 263 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ARL4AP40617 200 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PLAAQ9Y263 795 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 FIS1Q9Y3D6 152 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf118Q5T5N4 469 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CD58P19256 250 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 YY1AP1Q9H869 796 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GDAQ9Y2T3 454 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 RASGRF1Q13972 1273 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 USP14P54578 494 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 USP6P35125 1406 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 TRPA1O75762 1119 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CENPKQ9BS16 269 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ABCD1P33897 745 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ADCY2Q08462 1091 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GYS2P54840 703 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MTERF2Q49AM1 385 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 EMBQ6PCB8 327 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 TLK1Q9UKI8 766 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 FGGP02679 453 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 DRC3Q9H069 523 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CHUKO15111 745 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PALMO75781 387 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PRPSAP2O60256 369 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SRGAP2O75044 1071 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GNGT2O14610 69 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 RWDD2BP57060 319 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 BBS9Q3SYG4 887 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 BBS5Q8N3I7 341 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ACSL3O95573 720 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CDK8P49336 464 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SNAP25P60880 206 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 C7orf31Q8N865 590 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 OSTNP61366 133 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SULF1Q8IWU6 871 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 GINM1Q9NU53 330 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MAML1Q92585 1016 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB2P05120 415 aa22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MCAMP43121 646 aa22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SLC12A1Q13621 1099 aa22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CENPUQ71F23 418 aa22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PCGF5Q86SE9 256 aa22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.95■■□□□ 1.27
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