RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TPPPO94811 219 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 PDGFRBP09619 1106 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 RBP3P10745 1247 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 NAT2P11245 290 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC10P48553 1259 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TRPC1P48995 793 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF165P49910 485 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF132P52740 706 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF445P59923 1031 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 CCT2P78371 535 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 POU4F1Q01851 419 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 KLF10Q13118 480 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM29Q14134 588 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 SEPT2Q15019 361 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 BRD3Q15059 726 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 CTR9Q6PD62 1173 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 MYO1HQ8N1T3 1032 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 CDHR1Q96JP9 859 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 GP6Q9HCN6 339 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PRQ8 180 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 GPR42O15529 346 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SORBS3O60504 671 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 B4GALT3O60512 393 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 CD3EP07766 207 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ACRP10323 421 aa3.58□□□□□ -1.84
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