RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GJA5	P36382	358 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SAMM50	Q9Y512	469 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARID5B	Q14865	1188 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BANK1	Q8NDB2	785 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	N4BP3	O15049	544 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NRDC	O43847	1150 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ATP9A	O75110	1047 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GAP43	P17677	238 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	32.31	■■■□□ 2.76	1e-10	■■■□□ 14.6
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		32.31	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	WDR64	B1ANS9	1081 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LYPLA2	O95372	231 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PNMA3	Q9UL41	463 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TEX33	O43247	280 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PBX1	P40424	430 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LRRC41	Q15345	812 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STXBP2	Q15833	593 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NFASC	O94856	1347 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		32.29	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TPM2	P07951	284 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VPS16	Q9H269	839 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	POTEB2	H3BUK9	544 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PEX10	O60683	326 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RGS20	O76081	388 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCZ1B	P86790	482 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SKIL	P12757	684 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNA2	P16389	499 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ERCC3	P19447	782 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SFR1	Q86XK3	245 aa		32.26	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.76
CTDNEP1-208	ENST00000573600		B4DLN1	442 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZBTB39	O15060	712 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM13A	O94988	1023 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CETP	P11597	493 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ICAM3	P32942	547 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GTF2A2	P52657	109 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PSMC5	P62195	406 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CNTN2	Q02246	1040 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C4orf19	Q8IY42	314 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCNE2	O96020	404 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GUCY2C	P25092	1073 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PTPN21	Q16825	1174 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MROH8	Q9H579	483 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LGALS16	A8MUM7	142 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RSPH10B	P0C881	870 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PARVG	Q9HBI0	331 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ASTN1	O14525	1302 aa		32.22	■■■□□ 2.75

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