RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567092.1

CFAP20-206, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, human

TSL 2

Gene CFAP20, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP20-206	ENST00000567092	MAF1	Q9H063	256 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	PNMA2	Q9UL42	364 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	STXBP3	O00186	592 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	GNA11	P29992	359 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	TRAPPC10	P48553	1259 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	NLRP5	P59047	1200 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	KAT2B	Q92831	832 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	TNFRSF25	Q93038	417 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	SI	P14410	1827 aa		12.83	□□□□□ -0.35
CFAP20-206	ENST00000567092	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092		M0R2N6	131 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	ZBTB5	O15062	677 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	FIBP	O43427	364 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PPP6R2	O75170	966 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	DNAJB2	P25686	324 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PDE4D	Q08499	809 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	SLC39A14	Q15043	492 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF365	Q70YC5	407 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	BLID	Q8IZY5	108 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	BICD2	Q8TD16	824 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	SCFD2	Q8WU76	684 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	MYLIP	Q8WY64	445 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	HERVK_113	Q902F9	699 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	USP28	Q96RU2	1077 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PIGS	Q96S52	555 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PBX4	Q9BYU1	374 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	C6orf50	Q9HD87	102 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	IL23A	Q9NPF7	189 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	BMP15	O95972	392 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	CYP2C9	P11712	490 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	GPNMB	Q14956	572 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	GRIN2C	Q14957	1233 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	ADAL	Q6DHV7	355 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	MCTP2	Q6DN12	878 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PACS2	Q86VP3	889 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	FBXO11	Q86XK2	927 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	GPT2	Q8TD30	523 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PXMP2	Q9NR77	195 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	MMP3	P08254	477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	CPT1A	P50416	773 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	CCL23	P55773	120 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	LY6K	Q17RY6	165 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	USP38	Q8NB14	1042 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	SCLY	Q96I15	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	RMDN3	Q96TC7	470 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092		A0A1W2PQ27	194 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092		A0A1W2PQ64	194 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092		A0A1W2PQD8	194 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CFAP20-206	ENST00000567092	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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