RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	ANAPC15	P60006	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	IL2	P60568	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	NR1I3	Q14994	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	RTP5	Q14D33	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CPZ	Q66K79	652 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SCD	O00767	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	HIP1R	O75146	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TADA3	O75528	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	EVA1C	P58658	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	IGBP1	P78318	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PRR5	P85299	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	IRF9	Q00978	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	DSG1	Q02413	1049 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	GRIN1	Q05586	938 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TUSC3	Q13454	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ALG3	Q92685	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123		H7C1D1	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ABLIM1	O14639	778 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	F2	P00734	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CPE	P16870	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ID4	P47928	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	KCNC1	P48547	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SLURP1	P55000	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	DHCR24	Q15392	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	NEMP1	O14524	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FKBP9	O95302	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	KIF11	P52732	1056 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	STAT4	Q14765	748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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