RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.55■■□□□ 1.36
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.52■■□□□ 1.36
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXD13P35453 343 aa23.5■■□□□ 1.35
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYCT1Q8N699 235 aa23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYO6Q9UM54 1294 aa23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POTEB2H3BUK9 544 aa23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AKR1B10O60218 316 aa23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NR3C1P04150 777 aa23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERCC3P19447 782 aa23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFIL3Q16649 462 aa23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPXCR1Q8N123 301 aa23.49■■□□□ 1.35
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