RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	OSTM1	Q86WC4	334 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	DIRC2	Q96SL1	478 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	STK26	Q9P289	416 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	CBLC	Q9ULV8	474 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087X0B3	334 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC66	A2RUB6	948 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	FAM83G	A6ND36	823 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	SGSM2	O43147	1006 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	SRGAP3	O43295	1099 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	KPNA6	O60684	536 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	KRT15	P19012	456 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	NEK4	P51957	841 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PRR5	P85299	388 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP100	Q494V2	611 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	RPTN	Q6XPR3	784 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF605	Q86T29	641 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	UBR7	Q8N806	425 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	NETO2	Q8NC67	525 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3C2G	O75747	1445 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	MYOM2	P54296	1465 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934		M0R2C6	588 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	KCNK3	O14649	394 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PDE6A	P16499	860 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	NR1I3	Q14994	352 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	MLANA	Q16655	118 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	WNK4	Q96J92	1243 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	MTFR1L	Q9H019	292 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	PALD1	Q9ULE6	856 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	SLIT1	O75093	1534 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	MET	P08581	1390 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934		B4E1Z4	1266 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	WNT9A	O14904	365 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SLC27A2	O14975	620 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	GSTA4	O15217	222 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PDE8A	O60658	829 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	FLT3	P36888	993 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	JAM2	P57087	298 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CRY1	Q16526	586 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SEC14L1	Q92503	715 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PEX11G	Q96HA9	241 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	IFT57	Q9NWB7	429 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PPL	O60437	1756 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45

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