RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560576.1

TMOD2-204, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 2,348 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-204ENST00000560576 TTC22Q5TAA0 569 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 GLG1Q92896 1179 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 IGFLR1Q9H665 355 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 SQORQ9Y6N5 450 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 M0QZ92 97 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MEIS2O14770 477 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 DGKIO75912 1065 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 LINC00271P0C7V0 271 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 STAG3L1P0CL83 205 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MARK3P27448 753 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MRE11P49959 708 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 EVPLQ92817 2033 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD2-204ENST00000560576 WDR81Q562E7 1941 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 STXBP3O00186 592 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 NDUFV1P49821 464 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 ANTXR2P58335 489 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 NHLH1Q02575 133 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 ADAM15Q13444 863 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 IER5Q5VY09 327 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CASC1Q6TDU7 716 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 FBXL18Q96ME1 805 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MTA3Q9BTC8 594 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.65□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MAFGO15525 162 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 ATP9AO75110 1047 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 TBX10O75333 385 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CHMLP26374 656 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CD52P31358 61 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 IGBP1P78318 339 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MTMR1Q13613 665 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 RNF135Q8IUD6 432 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MYL10Q9BUA6 226 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 LY9Q9HBG7 655 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CCDC69A6NI79 296 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 LINC01565O15544 149 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CSPG5O95196 566 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CALM1P0DP23 149 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CALM2P0DP24 149 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 CALM3P0DP25 149 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 TMTC2Q8N394 836 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 AZI2Q9H6S1 392 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 JADE2Q9NQC1 790 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 TRPC6Q9Y210 931 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 SCG2P13521 617 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 INSRRP14616 1297 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 ITGB5P18084 799 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PDE4AP27815 886 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PAK2Q13177 524 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 UBE2SQ16763 222 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 EFHBQ8N7U6 833 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 EDAQ92838 391 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 NFASCO94856 1347 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 SGSM2O43147 1006 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PRC1O43663 620 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD2-204ENST00000560576 EYA4O95677 639 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms