RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 EPOPA6NHQ4 379 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 NBNO60934 754 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP3A4P08684 503 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 NLRP5P59047 1200 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 TFF2Q03403 129 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 GRB10Q13322 594 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 NLRX1Q86UT6 975 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 BICD2Q8TD16 824 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 HLA-CQ95604 372 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 MEIS1O00470 390 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 GJB5O95377 273 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF286BP0CG31 522 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP55Q53EZ4 464 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 MCTP2Q6DN12 878 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 METTL7BQ6UX53 244 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM86B1E9PN63 330 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 MTMR1Q13613 665 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 NEDD9Q14511 834 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 REV3LO60673 3130 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 LGR5O75473 907 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF15O94989 841 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ARP10275 920 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 DEFB103AP81534 67 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 BLIDQ8IZY5 108 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CDHR1Q96JP9 859 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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RABGGTA-210ENST00000559586 KCNQ1P51787 676 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ERVK-21P61565 698 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 GALNT17Q6IS24 598 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 SERINC5Q86VE9 423 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR20Q99678 358 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 INSL6Q9Y581 213 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 LCHNA4D1U4 455 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 LPXNO60711 386 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 AMHP03971 560 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 RSPH10BP0C881 870 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 CIITAP33076 1130 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT40Q6A162 431 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 OXER1Q8TDS5 423 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 LENG9Q96B70 501 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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RABGGTA-210ENST00000559586 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-210ENST00000559586 H3BRB1 525 aa22.76■■□□□ 1.23
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RABGGTA-210ENST00000559586 CAND2O75155 1236 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 GNAT1P11488 350 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 THPOP40225 353 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 WASF1Q92558 559 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 LINC01553A4QN01 128 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 ST18O60284 1047 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 LGALS2P05162 132 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 MBTPS1Q14703 1052 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TBCKQ8TEA7 893 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TNFRSF25Q93038 417 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 NFASCO94856 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXC8P31273 242 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF76P36508 570 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 USP11P51784 963 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 SP4Q02446 784 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-210ENST00000559586 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.73■■□□□ 1.23
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