RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.3■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 KCNA2P16389 499 aa22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 IGBP1P78318 339 aa22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 CLUL1Q15846 466 aa22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 PIEZO1Q92508 2521 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 TTC3P53804 2025 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 M0QZ92 97 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MBTPS2O43462 519 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 DGKIO75912 1065 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 IRS1P35568 1242 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 ANTXR2P58335 489 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MTMR1Q13613 665 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 P2RX5Q93086 422 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MTA3Q9BTC8 594 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MYL10Q9BUA6 226 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 SQORQ9Y6N5 450 aa22.28■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC69A6NI79 296 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MMP1P03956 469 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 LINC00271P0C7V0 271 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 STAG3L1P0CL83 205 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 ITGB5P18084 799 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MAP4K1Q92918 833 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 AZI2Q9H6S1 392 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 LY9Q9HBG7 655 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 CD207Q9UJ71 328 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.27■■□□□ 1.16
FOXN3-211ENST00000555855 CSPG5O95196 566 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CALM1P0DP23 149 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CALM2P0DP24 149 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CALM3P0DP25 149 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 INSRRP14616 1297 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PDE4AP27815 886 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CD52P31358 61 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 ADAM15Q13444 863 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 JADE2Q9NQC1 790 aa22.26■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 STXBP3O00186 592 aa22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 SGSM2O43147 1006 aa22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 NDUFV1P49821 464 aa22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.25■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PRC1O43663 620 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 MCM5P33992 734 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.159e-7■■■■■ 28.1
FOXN3-211ENST00000555855 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 TMEM87BQ96K49 555 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 FBXL18Q96ME1 805 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 TRPC6Q9Y210 931 aa22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 MRE11P49959 708 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 UBE2SQ16763 222 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 RNF135Q8IUD6 432 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 NME8Q8N427 588 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 SDF4Q9BRK5 362 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PADI3Q9ULW8 664 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.23■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 LINC01565O15544 149 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 ITGB1P05556 798 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 NHLH1Q02575 133 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 PAK2Q13177 524 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CAMK1Q14012 370 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
FOXN3-211ENST00000555855 TBX10O75333 385 aa22.21■■□□□ 1.15
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