RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	CD72	P21854	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MAP3K13	O43283	966 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	GHR	P10912	638 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ALAS1	P13196	640 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SNAP25	P60880	206 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617		F5H6K3	240 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TREH	O43280	583 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	EPCAM	P16422	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PDE4A	P27815	886 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	KLRC3	Q07444	240 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SEC24B	O95487	1268 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CHRNA1	P02708	482 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	HOXC8	P31273	242 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	MTAP	Q13126	283 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FZD5	Q13467	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	MYADM	Q96S97	322 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	HOXC13	P31276	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	LPIN1	Q14693	890 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	TCEAL3	Q969E4	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	EDNRB	P24530	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ZAP70	P43403	619 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SCAP	Q12770	1279 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR20	Q99678	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	NFIB	O00712	420 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PBX3	P40426	434 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CDK8	P49336	464 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	DGKD	Q16760	1214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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