RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 CDSNQ15517 529 aa7.64□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 STPG3Q8N7X2 389 aa7.64□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 CDC6Q99741 560 aa7.64□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.64□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 IL18BPO95998 194 aa7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 FIGNQ5HY92 759 aa7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 FBXW5Q969U6 566 aa7.63□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP2B1P20020 1258 aa7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 POLD1P28340 1107 aa7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 SELENOPP49908 381 aa7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 CD244Q9BZW8 370 aa7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.62□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF623O75123 536 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 GLRBP48167 497 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 PHF19Q5T6S3 580 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 C8orf37Q96NL8 207 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.61□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 HERVK_113P62684 666 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM209AQ5JX71 171 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 PTPN18Q99952 460 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 DEF6Q9H4E7 631 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 MSL2Q9HCI7 577 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.6□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 MAN2B1O00754 1011 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 AMY2AP04746 511 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 PDE6AP16499 860 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 AMY2BP19961 511 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 GUCY1A3Q02108 690 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 SERINC3Q13530 473 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 Q8TCH9 128 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 FBXO10Q9UK96 956 aa7.59□□□□□ -1.19
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 ST5P78524 1137 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 RBL2Q08999 1139 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 CRY1Q16526 586 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 EXOC2Q96KP1 924 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 LMF1Q96S06 567 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 EFCAB14O75071 495 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 PYGMP11217 842 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 ETV4P43268 484 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 STILQ15468 1287 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 OSTM1Q86WC4 334 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 SCYL1Q96KG9 808 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 CBLCQ9ULV8 474 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 MUSKO15146 869 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM153BP0C7A2 387 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 TACR2P21452 398 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 PTGS1P23219 599 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 AOAHP28039 575 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 RASA3Q14644 834 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 HS1BP3Q53T59 392 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 SPRED1Q7Z699 444 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 JMYQ8N9B5 988 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 WNK4Q96J92 1243 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 INCENPQ9NQS7 918 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 GALNT8Q9NY28 637 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms