RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 MTERF2Q49AM1 385 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SP8Q8IXZ3 490 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 GPATCH11Q8N954 259 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 AFF2P51816 1311 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PRELPP51888 382 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 DRP2Q13474 957 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SYNE4Q8N205 404 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 HDAC11Q96DB2 347 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PPFIA2O75334 1257 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MYL3P08590 195 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SGO2Q562F6 1265 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MYO10Q9HD67 2058 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L10C9JJH3 530 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 AP3M2P53677 418 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NLRP4Q96MN2 994 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 FANCLQ9NW38 375 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TTC36A6NLP5 189 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 GDF11O95390 407 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SLFN14P0C7P3 912 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MXI1P50539 228 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TAP1Q03518 808 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MESDQ14696 234 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SUSD4Q5VX71 490 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 LRGUKQ96M69 825 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RMDN3Q96TC7 470 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 H7C1W4 665 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CLDN3O15551 220 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 LCORLQ8N3X6 602 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PSMB7Q99436 277 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PMLP29590 882 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 DENND3A2RUS2 1198 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SORBS3O60504 671 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 CALB1P05937 261 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PLCG1P19174 1290 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TTC13Q8NBP0 860 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 FAM71BQ8TC56 605 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PANX2Q96RD6 677 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PIGSQ96S52 555 aa6.9□□□□□ -1.31
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PDE4D-226ENST00000546160 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 GINM1Q9NU53 330 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 IFT172Q9UG01 1749 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PODXLO00592 558 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 BUB1O43683 1085 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF853P0CG23 659 aa6.89□□□□□ -1.31
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PDE4D-226ENST00000546160 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 EFCC1Q9HA90 598 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SUN1O94901 812 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 STX1BP61266 288 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 RASSF7Q02833 373 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 SLMAPQ14BN4 828 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ALX1Q15699 326 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 C7orf31Q8N865 590 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-226ENST00000546160 ASB14A6NK59 587 aa6.89□□□□□ -1.31
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