RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538552.5

C16orf62-208, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, human

TSL 2

Gene C16orf62, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.79	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	BACH1	O14867	736 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	STX6	O43752	255 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF862	O60290	1169 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	MARCH6	O60337	910 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	PSAP	P07602	524 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	HOXC8	P31273	242 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	ADAM17	P78536	824 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	PKP1	Q13835	747 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	PTGIS	Q16647	500 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	WNT8B	Q93098	351 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.78	□□□□□ -0.2
C16orf62-208	ENST00000538552	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TREH	O43280	583 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	STBD1	O95210	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	INSRR	P14616	1297 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	SFN	P31947	248 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	JAK3	P52333	1124 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	PTGDR	Q13258	359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	IL17A	Q16552	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	CYP2C18	P33260	490 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	CEP290	O15078	2479 aa		13.76	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	POTEM	A6NI47	508 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TEC	P42680	631 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	IGBP1	P78318	339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	EPHA7	Q15375	998 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	GRIK4	Q16099	956 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	BAD	Q92934	168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.75	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	SLITRK3	O94933	977 aa		13.74	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	TIMP1	P01033	207 aa		13.74	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	RAG1	P15918	1043 aa		13.74	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	SLC26A2	P50443	739 aa		13.74	□□□□□ -0.21
C16orf62-208	ENST00000538552	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21

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