RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 IDI1Q13907 227 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 RASGRF1Q13972 1273 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 TESK1Q15569 626 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-214ENST00000530727 PMLP29590 882 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-214ENST00000530727 Q8N1Y9 231 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 SEC14L1Q92503 715 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-214ENST00000530727 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-214ENST00000530727 CREB3O43889 395 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-214ENST00000530727 SIAH1Q8IUQ4 282 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 DCAF4Q8WV16 495 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 JDP2Q8WYK2 163 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 OSBP2Q969R2 916 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 CDC6Q99741 560 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-214ENST00000530727 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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