RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	CSPG5	O95196	566 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RB1	P06400	928 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	NDUFV1	P49821	464 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	APBB2	Q92870	758 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR20	Q99678	358 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	MEIS2	O14770	477 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	MAFG	O15525	162 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	CTSH	P09668	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	HYAL1	Q12794	435 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC27A2	O14975	620 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SORBS3	O60504	671 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TBX10	O75333	385 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TCF15	Q12870	199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	GRM6	O15303	877 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	BMPR1A	P36894	532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RCAN1	P53805	252 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ZXDA	P98168	799 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	HIC1	Q14526	733 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TREH	O43280	583 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ADAM17	P78536	824 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	MTMR1	Q13613	665 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	LINC01565	O15544	149 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	MMP1	P03956	469 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNA2	P16389	499 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	KRT32	Q14532	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-213	ENST00000530120	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-213	ENST00000530120	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-213	ENST00000530120	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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