RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPEF2Q9C093 1822 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CENPEQ02224 2701 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CACNA1EQ15878 2313 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF212BA8MTL3 300 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PATE3B3GLJ2 98 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L10C9JJH3 530 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 E9PAM4 449 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLK4O00444 970 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GDF11O95390 407 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PARNO95453 639 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANXA1P04083 346 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEFMP07197 916 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGK2P07205 417 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCER1AP12319 257 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGB6P18564 788 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTSWP56202 376 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 BACE1P56817 501 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPC5P78333 572 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKX3-2P78367 333 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 IRX4P78413 519 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRNDQ07001 517 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 VAC14Q08AM6 782 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM62Q0P6H9 643 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFIAQ12857 509 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 LMAN2Q12907 356 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLS1Q14651 629 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SKIDA1Q1XH10 827 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf27AQ580R0 203 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAALADL2Q58DX5 795 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM63BQ5T3F8 832 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDXDC2PQ6P474 469 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 HHIPL2Q6UWX4 724 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPRG1Q6ZUI0 275 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLCO6A1Q86UG4 719 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR5BQ86VZ2 330 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCAPG2Q86XI2 1143 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCEMP1Q8IX19 187 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHC2Q8IXK0 858 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABRAQ8N0Z2 381 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC34A3Q8N130 599 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GALNT15Q8N3T1 639 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLBD2Q8NHP8 589 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAGE1Q8TC20 777 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 RASGRP4Q8TDF6 673 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 AFG1LQ8WV93 481 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAB3Q8WWW8 586 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF11Q92914 225 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NXPE3Q969Y0 559 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 LURAP1Q96LR2 239 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAMK1GQ96NX5 476 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 LGMNQ99538 433 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 FEZ1Q99689 392 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR3GLQ9BT43 218 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 IER2Q9BTL4 223 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PI4K2AQ9BTU6 479 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 AMNQ9BXJ7 453 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CARD14Q9BXL6 1004 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM34Q9BYJ4 488 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIS18AQ9NYP9 233 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 AK5Q9Y6K8 562 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMA1P25391 3075 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 DOCK2Q92608 1830 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L15C9J2P7 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L13C9JLJ4 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L11C9JVI0 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L18D6R9N7 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L22D6RA61 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L17D6RBQ6 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L19D6RCP7 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP17L20D6RJB6 530 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7ESF4 209 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNK3O14649 394 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLIN1O60240 522 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAF5LO75529 589 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASNSP08243 561 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE4AP27815 886 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHKA1P46020 1223 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLGA2Q08379 1002 aa2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms