RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYH8P13535 1937 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNKSO95271 1327 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAMTS4O75173 837 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDKL5O76039 1030 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TGFB1P01137 390 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLB1P16278 677 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF75DP51815 510 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 HTRA3P83110 453 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP2B2Q01814 1243 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 STX1AQ16623 288 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 C16orf46Q6P387 395 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 LUZP1Q86V48 1076 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR13H1Q8NG92 308 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 KINO60870 393 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTLL1O95922 423 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC25BP30305 580 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF5BP33176 963 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHMT1P34896 483 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF165P49910 485 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANTXR2P58335 489 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GABPAQ06546 454 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 DRC7Q8IY82 874 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 FANCBQ8NB91 859 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPC24Q8NBT2 197 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGS22Q8NE09 1264 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP28Q96RU2 1077 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 LY9Q9HBG7 655 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GINM1Q9NU53 330 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GGA3Q9NZ52 723 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPME1Q9Y570 386 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 LAMB1P07942 1786 aa6.36□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCN4AP35499 1836 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQ27 194 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQ64 194 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQD8 194 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMIM22K7EJ46 135 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NMT2O60551 498 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAM11O75078 769 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 YEATS4O95619 227 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASNSP08243 561 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 AKR1B1P15121 316 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 XBP1P17861 261 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTGS1P23219 599 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ME1P48163 572 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNAQP50148 359 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 RCAN1P53805 252 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 STK38Q15208 465 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms