RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 IDI2Q9BXS1 227 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT82Q9NSB4 513 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PDLIM1O00151 329 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 INHAP05111 366 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PCNAP12004 261 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC16A2P36021 539 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SMARCE1Q969G3 411 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TEPSINQ96N21 525 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB118Q96PH6 123 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 A6NCN8 305 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC72A6NJI9 287 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 M0QX08 132 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 IDEP14735 1019 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 HSPA4P34932 840 aa5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K12Q12852 859 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBA1AQ71U36 451 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RTL10Q7L3V2 364 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC39CQ8N584 583 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPN18Q99952 460 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 AHCYL1O43865 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 PEX5P50542 639 aa5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC102BQ68D86 513 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA17Q96L03 361 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 COPRSQ9NQ92 184 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8AA7E2F4 631 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFAB1O14561 156 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 KCNJ13O60928 360 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 TPM4P67936 248 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 CRY1Q16526 586 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 TEKT4Q8WW24 435 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDL1Q96EA4 605 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.03□□□□□ -1.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL41O60662 606 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 KATNA1O75449 491 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF8O76064 485 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 BPNT1O95861 308 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-213ENST00000496055 FESP07332 822 aa5.03□□□□□ -1.6
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